Heute gibt es mal wieder ein Cross-Over. Letztens gab es ja schon mal eines mit Full Metal Alchemist, diesmal mit Danganronpa! Die Story beginnt so: Kindaichi und seine Kindheitsfreundin Miyuki besuchen gemeinsam einen Vergnügungspark, bis sie auf der Achterbahn ein Fall erwartet und einem Fahrgast der Kopf abgetrennt wird. Der Fall ist schnell gelöst, doch auf dem Rückweg beobachtet Kindaichi zwei in Schwarz gekleidete Männer bei einer Geldübergabe. Dummerweise wird er K.O geschlagen und wacht zusammen mit Miyuki in einem verriegelten Gebäude auf. Dort erscheint Monokuma und zwingt sie und andere Rätsel zu lösen, ansonsten sterben sie. Kann Kindaichi seine Miyuki beschützen und aus dem Gebäude entkommen?